Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Lig1P37913 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Lig1P37913 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Lig1P37913 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms