Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PtprkP35822 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PtprkP35822 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
PtprkP35822 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PtprkP35822 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.1 ms