Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddit3P35639 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ddit3P35639 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms