Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cd28P31041 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cd28P31041 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms