Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Tacr1P30548 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Tacr1P30548 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms