Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Pabpc1P29341 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pabpc1P29341 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms