Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
PtprmP28828 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PtprmP28828 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
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