Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
RxrgP28705 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxrgP28705 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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