Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

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Length 298 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
NapbP28663 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NapbP28663 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapbP28663 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapbP28663 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapbP28663 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
NapbP28663 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NapbP28663 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NapbP28663 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NapbP28663 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NapbP28663 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms