Protein–RNA interactions for Protein: P28033

Cebpb, CCAAT/enhancer-binding protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CebpbP28033 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CebpbP28033 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CebpbP28033 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
CebpbP28033 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms