Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Xrcc5P27641 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms