Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SnrpbP27048 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SnrpbP27048 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms