Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CftrP26361 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
CftrP26361 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.65
CftrP26361 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
CftrP26361 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CftrP26361 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CftrP26361 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CftrP26361 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CftrP26361 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CftrP26361 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
CftrP26361 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
CftrP26361 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CftrP26361 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CftrP26361 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
CftrP26361 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CftrP26361 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CftrP26361 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CftrP26361 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CftrP26361 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CftrP26361 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CftrP26361 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CftrP26361 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CftrP26361 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CftrP26361 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CftrP26361 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC31.49■■■□□ 2.63
CftrP26361 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
CftrP26361 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CftrP26361 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CftrP26361 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CftrP26361 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
CftrP26361 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CftrP26361 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CftrP26361 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms