Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChgaP26339 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ChgaP26339 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ChgaP26339 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ChgaP26339 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms