Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb7P26011 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb7P26011 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms