Protein–RNA interactions for Protein: P25322

Ccnd1, G1/S-specific cyclin-D1, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd1P25322 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ccnd1P25322 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Ccnd1P25322 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms