Protein–RNA interactions for Protein: P24788

Cdk11b, Cyclin-dependent kinase 11B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk11bP24788 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cdk11bP24788 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cdk11bP24788 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdk11bP24788 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms