Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxd12P23812 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Hoxd12P23812 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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