Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ggta1P23336 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms