Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd3eP22646 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd3eP22646 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms