Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ms4a2P20490 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ms4a2P20490 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms