Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Fcer1aP20489 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Fcer1aP20489 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms