Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VimP20152 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VimP20152 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VimP20152 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VimP20152 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VimP20152 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VimP20152 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VimP20152 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VimP20152 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms