Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PtpraP18052 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PtpraP18052 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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