Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PcnaP17918 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PcnaP17918 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms