Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Usp53P15975 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Usp53P15975 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp53P15975 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp53P15975 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Usp53P15975 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Usp53P15975 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Usp53P15975 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Usp53P15975 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp53P15975 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp53P15975 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp53P15975 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp53P15975 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp53P15975 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms