Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scd2P13011 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scd2P13011 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scd2P13011 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms