Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nr4a1P12813 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Nr4a1P12813 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms