Protein–RNA interactions for Protein: P11378

Tnp2, Nuclear transition protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp2P11378 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Tnp2P11378 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tnp2P11378 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms