Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Hoxd4P10628 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxd4P10628 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms