Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P10404 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
P10404 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P10404 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P10404 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P10404 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P10404 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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