Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CatspereP0DP43 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CatspereP0DP43 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms