Protein–RNA interactions for Protein: P0DN34

Ndufb1, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb1P0DN34 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Ndufb1P0DN34 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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Ndufb1P0DN34 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ndufb1P0DN34 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
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Ndufb1P0DN34 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Ndufb1P0DN34 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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