Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Igsf6P0C6B7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Igsf6P0C6B7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms