Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

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Length 354 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hoxb2P0C1T1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hoxb2P0C1T1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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