Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Itgb1P09055 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Itgb1P09055 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms