Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Spta1P08032 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Spta1P08032 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Spta1P08032 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms