Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
TtrP07309 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
TtrP07309 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
TtrP07309 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
TtrP07309 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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