Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hbb-bh1P04444 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hbb-bh1P04444 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms