Protein–RNA interactions for Protein: P04187

Gzmb, Granzyme B(G,H), mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GzmbP04187 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
GzmbP04187 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
GzmbP04187 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
GzmbP04187 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GzmbP04187 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms