Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Hoxa7P02830 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hoxa7P02830 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hoxa7P02830 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms