Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H2-Ab1P01921 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2-Ab1P01921 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms