Protein–RNA interactions for Protein: P01800

Ig heavy chain V-III region T957, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01800 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01800 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P01800 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P01800 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P01800 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P01800 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01800 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01800 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01800 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms