Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01672 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01672 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01672 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01672 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01672 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01672 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01672 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
P01672 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
P01672 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
P01672 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms