Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01652 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
P01652 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01652 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01652 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01652 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01652 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01652 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01652 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01652 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01652 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01652 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01652 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01652 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms