Protein–RNA interactions for Protein: P01029

C4b, Complement C4-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bP01029 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
C4bP01029 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
C4bP01029 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4bP01029 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
C4bP01029 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
C4bP01029 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C4bP01029 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C4bP01029 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
C4bP01029 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C4bP01029 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C4bP01029 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4bP01029 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C4bP01029 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C4bP01029 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C4bP01029 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms