Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
MscO88940 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MscO88940 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MscO88940 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MscO88940 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
MscO88940 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MscO88940 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MscO88940 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MscO88940 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MscO88940 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MscO88940 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MscO88940 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MscO88940 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MscO88940 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MscO88940 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms