Protein–RNA interactions for Protein: O88892

Serf1, Small EDRK-rich factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 62 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serf1O88892 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Serf1O88892 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Serf1O88892 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Serf1O88892 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Serf1O88892 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Serf1O88892 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Serf1O88892 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Serf1O88892 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms