Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Apaf1O88879 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Apaf1O88879 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms