Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tom1O88746 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tom1O88746 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tom1O88746 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms